MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014002	ATC	2	6	179991	179996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494838
3502	NC_014002	GA	3	6	180143	180148	50 %	0 %	50 %	0 %	294494838
3503	NC_014002	ATA	2	6	180183	180188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494838
3504	NC_014002	GATG	2	8	180207	180214	25 %	25 %	50 %	0 %	294494838
3505	NC_014002	TTCT	2	8	180217	180224	0 %	75 %	0 %	25 %	294494838
3506	NC_014002	AT	3	6	180229	180234	50 %	50 %	0 %	0 %	294494838
3507	NC_014002	CTG	2	6	180279	180284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494838
3508	NC_014002	TCT	2	6	180391	180396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494838
3509	NC_014002	ATG	2	6	180398	180403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494838
3510	NC_014002	AAT	2	6	180416	180421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494838
3511	NC_014002	TACA	2	8	180458	180465	50 %	25 %	0 %	25 %	294494838
3512	NC_014002	TCC	2	6	180490	180495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494838
3513	NC_014002	TAT	2	6	180541	180546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494838
3514	NC_014002	TGA	2	6	180573	180578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494838
3515	NC_014002	GGT	2	6	180652	180657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494838
3516	NC_014002	TAT	2	6	180698	180703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494838
3517	NC_014002	CGGAA	2	10	180760	180769	40 %	0 %	40 %	20 %	294494838
3518	NC_014002	GA	3	6	180788	180793	50 %	0 %	50 %	0 %	294494838
3519	NC_014002	GAA	2	6	180800	180805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494838
3520	NC_014002	AGGC	2	8	180839	180846	25 %	0 %	50 %	25 %	294494838
3521	NC_014002	TCC	2	6	180986	180991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494838
3522	NC_014002	T	6	6	180992	180997	0 %	100 %	0 %	0 %	294494838
3523	NC_014002	AGA	2	6	181040	181045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494838
3524	NC_014002	AT	3	6	181059	181064	50 %	50 %	0 %	0 %	294494838
3525	NC_014002	A	7	7	181066	181072	100 %	0 %	0 %	0 %	294494838
3526	NC_014002	TTAT	2	8	181073	181080	25 %	75 %	0 %	0 %	294494839
3527	NC_014002	TGA	2	6	181094	181099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494839
3528	NC_014002	CTG	2	6	181124	181129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494839
3529	NC_014002	CAATA	2	10	181152	181161	60 %	20 %	0 %	20 %	294494839
3530	NC_014002	TCC	2	6	181311	181316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494839
3531	NC_014002	AAATG	2	10	181335	181344	60 %	20 %	20 %	0 %	294494839
3532	NC_014002	CTC	2	6	181395	181400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494839
3533	NC_014002	GT	3	6	181433	181438	0 %	50 %	50 %	0 %	294494839
3534	NC_014002	ATA	2	6	181505	181510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494839
3535	NC_014002	ATT	2	6	181526	181531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494839
3536	NC_014002	CAA	2	6	181584	181589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494839
3537	NC_014002	TAT	2	6	181630	181635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494839
3538	NC_014002	TTG	2	6	181799	181804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494839
3539	NC_014002	ATT	2	6	181919	181924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494839
3540	NC_014002	TGA	3	9	181950	181958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494839
3541	NC_014002	TAA	2	6	182045	182050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494839
3542	NC_014002	ATC	2	6	182062	182067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494839
3543	NC_014002	TTTC	2	8	182165	182172	0 %	75 %	0 %	25 %	294494840
3544	NC_014002	ATG	2	6	182226	182231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494840
3545	NC_014002	TC	3	6	182250	182255	0 %	50 %	0 %	50 %	294494840
3546	NC_014002	CAATTT	2	12	182269	182280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294494840
3547	NC_014002	TAC	2	6	182296	182301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494840
3548	NC_014002	CCTGA	2	10	182312	182321	20 %	20 %	20 %	40 %	294494840
3549	NC_014002	AAT	2	6	182339	182344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494840
3550	NC_014002	TGA	3	9	182431	182439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494840
3551	NC_014002	ACA	2	6	182489	182494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494840
3552	NC_014002	TCC	2	6	182514	182519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494840
3553	NC_014002	ATC	2	6	182596	182601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494840
3554	NC_014002	CGA	2	6	182623	182628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494840
3555	NC_014002	CA	3	6	182777	182782	50 %	0 %	0 %	50 %	294494840
3556	NC_014002	ATC	2	6	182792	182797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494840
3557	NC_014002	AGT	2	6	182818	182823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494840
3558	NC_014002	GAGG	2	8	182852	182859	25 %	0 %	75 %	0 %	294494840
3559	NC_014002	TGA	2	6	183019	183024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494840
3560	NC_014002	AAC	2	6	183025	183030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494840
3561	NC_014002	CTGC	2	8	183128	183135	0 %	25 %	25 %	50 %	294494840
3562	NC_014002	TC	3	6	183138	183143	0 %	50 %	0 %	50 %	294494840
3563	NC_014002	CAG	2	6	183207	183212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494840
3564	NC_014002	GAAA	2	8	183241	183248	75 %	0 %	25 %	0 %	294494840
3565	NC_014002	CGC	2	6	183267	183272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494841
3566	NC_014002	CTT	2	6	183277	183282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494841
3567	NC_014002	GAC	2	6	183325	183330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494841
3568	NC_014002	TCAA	2	8	183349	183356	50 %	25 %	0 %	25 %	294494841
3569	NC_014002	TCC	2	6	183438	183443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494841
3570	NC_014002	GTG	2	6	183485	183490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494841
3571	NC_014002	TAT	2	6	183516	183521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494841
3572	NC_014002	GCT	2	6	183553	183558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494841
3573	NC_014002	A	7	7	183663	183669	100 %	0 %	0 %	0 %	294494841
3574	NC_014002	ATT	3	9	183709	183717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494841
3575	NC_014002	TGG	2	6	183725	183730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494841
3576	NC_014002	CAG	2	6	183780	183785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494842
3577	NC_014002	TAT	2	6	183817	183822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494842
3578	NC_014002	TGG	2	6	183895	183900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494842
3579	NC_014002	TTC	2	6	183913	183918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494842
3580	NC_014002	CGG	2	6	183919	183924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494842
3581	NC_014002	T	6	6	183943	183948	0 %	100 %	0 %	0 %	294494842
3582	NC_014002	A	6	6	184001	184006	100 %	0 %	0 %	0 %	294494842
3583	NC_014002	T	6	6	184022	184027	0 %	100 %	0 %	0 %	294494842
3584	NC_014002	CATCT	2	10	184075	184084	20 %	40 %	0 %	40 %	294494842
3585	NC_014002	TTC	2	6	184292	184297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_014002	CTGTG	2	10	184433	184442	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3587	NC_014002	GTT	2	6	184467	184472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014002	TA	3	6	184496	184501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014002	A	6	6	184578	184583	100 %	0 %	0 %	0 %	294494843
3590	NC_014002	TAT	2	6	184607	184612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494843
3591	NC_014002	TA	3	6	184624	184629	50 %	50 %	0 %	0 %	294494843
3592	NC_014002	AGGA	2	8	184694	184701	50 %	0 %	50 %	0 %	294494843
3593	NC_014002	CTC	2	6	184744	184749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494843
3594	NC_014002	CAA	2	6	184753	184758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494843
3595	NC_014002	TAT	2	6	184901	184906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494843
3596	NC_014002	ATC	2	6	184923	184928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494843
3597	NC_014002	A	6	6	184983	184988	100 %	0 %	0 %	0 %	294494843
3598	NC_014002	GAA	2	6	185043	185048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494843
3599	NC_014002	TAT	2	6	185181	185186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494843
3600	NC_014002	GCT	2	6	185204	185209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494843
3601	NC_014002	CAGT	2	8	185234	185241	25 %	25 %	25 %	25 %	294494843
3602	NC_014002	TGG	2	6	185255	185260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494843
3603	NC_014002	ATC	2	6	185349	185354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494843
3604	NC_014002	A	6	6	185420	185425	100 %	0 %	0 %	0 %	294494843
3605	NC_014002	GAT	2	6	185619	185624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494843
3606	NC_014002	GAA	2	6	185677	185682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014002	AGA	2	6	185699	185704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494844
3608	NC_014002	ATG	2	6	185728	185733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494844
3609	NC_014002	TGC	2	6	185759	185764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494844
3610	NC_014002	TA	3	6	185780	185785	50 %	50 %	0 %	0 %	294494844
3611	NC_014002	CAG	2	6	185799	185804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494844
3612	NC_014002	TTG	2	6	185890	185895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494844
3613	NC_014002	A	6	6	185926	185931	100 %	0 %	0 %	0 %	294494844
3614	NC_014002	CTGAT	2	10	186034	186043	20 %	40 %	20 %	20 %	294494844
3615	NC_014002	TTC	2	6	186063	186068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494844
3616	NC_014002	GGT	2	6	186120	186125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494844
3617	NC_014002	CA	3	6	186176	186181	50 %	0 %	0 %	50 %	294494844
3618	NC_014002	A	6	6	186190	186195	100 %	0 %	0 %	0 %	294494844
3619	NC_014002	A	6	6	186258	186263	100 %	0 %	0 %	0 %	294494844
3620	NC_014002	GAT	2	6	186303	186308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494844
3621	NC_014002	AT	3	6	186361	186366	50 %	50 %	0 %	0 %	294494845
3622	NC_014002	CAA	2	6	186422	186427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494845
3623	NC_014002	GAT	2	6	186429	186434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494845
3624	NC_014002	GA	3	6	186444	186449	50 %	0 %	50 %	0 %	294494845
3625	NC_014002	ACT	2	6	186460	186465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494845
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3871	NC_014002	CATA	2	8	199529	199536	50 %	25 %	0 %	25 %	294494856
3872	NC_014002	GAC	2	6	199537	199542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494856
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3944	NC_014002	AATC	3	12	203596	203607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3987	NC_014002	TTTCT	2	10	205980	205989	0 %	80 %	0 %	20 %	294494863
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3991	NC_014002	GTG	2	6	206132	206137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494863
3992	NC_014002	CAG	2	6	206139	206144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494863
3993	NC_014002	AGGTA	2	10	206182	206191	40 %	20 %	40 %	0 %	294494863
3994	NC_014002	TGC	2	6	206282	206287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3995	NC_014002	TCT	2	6	206309	206314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494864
3996	NC_014002	TA	3	6	206372	206377	50 %	50 %	0 %	0 %	294494864
3997	NC_014002	TCCA	2	8	206409	206416	25 %	25 %	0 %	50 %	294494864
3998	NC_014002	CTTC	2	8	206466	206473	0 %	50 %	0 %	50 %	294494864
3999	NC_014002	TGA	2	6	206504	206509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494864
4000	NC_014002	ATG	2	6	206656	206661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494864

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